RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.096e-7■□□□□ 8.9
OPN3-201ENST00000366554 XPR1Q9UBH6 696 aa21.88■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.88■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 GPIP06744 558 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 OLIG2Q13516 323 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SLC12A1Q13621 1099 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 FUNDC1Q8IVP5 155 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SNX25Q9H3E2 840 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 RNF103O00237 685 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 HOXC6P09630 235 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 HADHAP40939 763 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 BNIP2Q12982 314 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB33Q86T24 672 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SCML4Q8N228 414 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 LEMD2Q8NC56 503 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CEP41Q9BYV8 373 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CARD8Q9Y2G2 431 aa21.87■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 HACD1B0YJ81 288 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 GFAPP14136 432 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SERPINB1P30740 379 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ARL2P36404 184 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 YME1L1Q96TA2 773 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 MAP10Q9P2G4 905 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SIP14410 1827 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CENPBD1B2RD01 187 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB7AO95365 584 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 PSAPP07602 524 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SDC4P31431 198 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TBPL2Q6SJ96 375 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TP53INP1Q96A56 240 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 FIS1Q9Y3D6 152 aa21.86■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 XYLBO75191 536 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ALBP02768 609 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 HTR1AP08908 422 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CHRNB1P11230 501 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 PRPSAP1Q14558 356 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SLX4IPQ5VYV7 408 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 GPR78Q96P69 363 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ARPC2O15144 300 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SLC22A1O15245 554 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 GPC4O75487 556 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 NTRK1P04629 796 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CAP2P40123 477 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ACTR2P61160 394 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.091e-7■□□□□ 11.3
OPN3-201ENST00000366554 MUL1Q969V5 352 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 P2RY11Q96G91 374 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 OMDQ99983 421 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ING2Q9H160 280 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SP140LQ9H930 580 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 PXMP2Q9NR77 195 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CHRAC1Q9NRG0 131 aa21.85■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CILPO75339 1184 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 DPY19L1Q2PZI1 675 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TTC23LQ6PF05 361 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ZPBP2Q6X784 338 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 KCNMB4Q86W47 210 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 UBXN10Q96LJ8 280 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 M0QX08 132 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CYP3A5P20815 502 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 SAT1P21673 171 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 CXCR2P25025 360 aa21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
OPN3-201ENST00000366554 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms