RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 BIRC8Q96P09 236 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 FCRL5Q96RD9 977 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 APOL2Q9BQE5 337 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 GLOD4Q9HC38 313 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 BFARQ9NZS9 450 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM221A6NGB7 291 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 DNAJA2O60884 412 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 ITGB8P26012 769 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 PMLP29590 882 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 SERPINB9P50453 376 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 NDST2P52849 883 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A3Q00325 362 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 BMPR2Q13873 1038 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 SPIDRQ14159 915 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 CES3Q6UWW8 571 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 ZFP28Q8NHY6 868 aa18.78■□□□□ 0.6
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SPNS1-204ENST00000352260 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.78■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa18.78■□□□□ 0.6
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SPNS1-204ENST00000352260 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
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SPNS1-204ENST00000352260 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 CNTFP26441 200 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 CD97P48960 835 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 MTTPP55157 894 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC36Q1X8D7 754 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 TIFABQ6ZNK6 161 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA22Q8NHS9 363 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 HMCESQ96FZ2 354 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 HAUS8Q9BT25 410 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.68e-6■□□□□ 10.3
SPNS1-204ENST00000352260 SLC17A6Q9P2U8 582 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 AK5Q9Y6K8 562 aa18.77■□□□□ 0.6
SPNS1-204ENST00000352260 HMX2A2RU54 273 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 E9PBE3 544 aa18.76■□□□□ 0.59
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SPNS1-204ENST00000352260 ABLIM3O94929 683 aa18.76■□□□□ 0.59
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SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
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SPNS1-204ENST00000352260 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.76■□□□□ 0.59
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SPNS1-204ENST00000352260 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
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SPNS1-204ENST00000352260 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 MYEOVQ96EZ4 313 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 DNMT3LQ9UJW3 386 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC160A6NGH7 325 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 H0YJX3 145 aa18.75■□□□□ 0.59
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SPNS1-204ENST00000352260 PEX11BO96011 259 aa18.75■□□□□ 0.59
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SPNS1-204ENST00000352260 TIMP1P01033 207 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 CDH17Q12864 832 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 ANO4Q32M45 955 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 TPGS2Q68CL5 300 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 PACS1Q6VY07 963 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00523Q86TU6 105 aa18.75■□□□□ 0.59
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