RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 SAC3D1A6NKF1 404 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 FFAR3O14843 346 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 GPR42O15529 346 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 HSMCR30P0CW71 290 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TAF13Q15543 124 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC185Q8N715 623 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C1orf127Q8N9H9 656 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRO-202ENST00000348962 NFKBIEO00221 500 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KRT75O95678 551 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LILRA4P59901 499 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TEAD4Q15561 434 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CHSY3Q70JA7 882 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NOD2Q9HC29 1040 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MDM4O15151 490 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 EPORP19235 508 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 POLD2P49005 469 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ECM1Q16610 540 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TEX44Q53QW1 395 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GDF3Q9NR23 364 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 VWA7Q9Y334 891 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF844Q08AG5 666 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 STK32CQ86UX6 486 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 BAP1Q92560 729 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 REEP1Q9H902 201 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CYLDQ9NQC7 956 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PEX11AO75192 247 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SNAP47Q5SQN1 464 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CDC73Q6P1J9 531 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 H3BNH8 94 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FZD9O00144 591 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ARVCFO00192 962 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PEX10O60683 326 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 STBD1O95210 358 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MYL12AP19105 171 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CDH4P55283 916 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SLC20A2Q08357 652 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KCTD5Q9NXV2 234 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PDP2Q9P2J9 529 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ASB3Q9Y575 518 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 INSL6Q9Y581 213 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CPQQ9Y646 472 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 E7ENQ6 273 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ATG13O75143 517 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KRT33AO76009 404 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NDST3O95803 873 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ACRP10323 421 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PTPN9P43378 593 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 AADACL2Q6P093 401 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ING5Q8WYH8 240 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LINGO1Q96FE5 620 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 S100A13Q99584 98 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CORO2BQ9UQ03 480 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 H3BM21 787 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FSCN2O14926 492 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 UBOX5O94941 541 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CAP1Q01518 475 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SNX27Q96L92 541 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MAGEH1Q9H213 219 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KCNK4Q9NYG8 393 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms