RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP1R3AQ16821 1122 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM207Q6UWW9 146 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ABI1Q8IZP0 508 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 C1orf74Q96LT6 269 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 GLT1D1Q96MS3 346 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TSC22D3Q99576 134 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGEF37A1IGU5 675 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RAMP2O60895 175 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP6AP2O75787 350 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RAG1P15918 1043 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PEX2P28328 305 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CDC16Q13042 620 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 FBXO48Q5FWF7 155 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 HECTD2Q5U5R9 776 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RNF180Q86T96 592 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 DSELQ8IZU8 1212 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa19.51■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 SMIM24O75264 130 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CLEC6AQ6EIG7 209 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TRAF7Q6Q0C0 670 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ISLR2Q6UXK2 745 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 OR13C4Q8NGS5 318 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM248Q9NWD8 314 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 POU4F1Q01851 419 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TAS1R1Q7RTX1 841 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CILP2Q8IUL8 1156 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TTC16Q8NEE8 873 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RTKNQ9BST9 563 aa19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RGSL1A5PLK6 1076 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 A8MT66 165 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 THOP1P52888 689 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 C1QTNF8P60827 252 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 DSG1Q02413 1049 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM83EQ2M2I3 478 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RTP2Q5QGT7 225 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TMCO4Q5TGY1 634 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 NADSYN1Q6IA69 706 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 GK5Q6ZS86 529 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 DHDDSQ86SQ9 333 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ARRDC2Q8TBH0 407 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 BTN2A3PQ96KV6 586 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 C8orf48Q96LL4 319 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ECSITQ9BQ95 431 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CLIC5Q9NZA1 410 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A0U1RQS6 177 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 AOC2O75106 756 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 THRAP10827 490 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC2A3P11169 496 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 COL6A2P12110 1019 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RPL17P18621 184 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 DPP6P42658 865 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RPS6KA3P51812 740 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 NDST2P52849 883 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 MTTPP55157 894 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CDH13P55290 713 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TECRLQ5HYJ1 363 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 METTL21CQ5VZV1 264 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CYP2S1Q96SQ9 504 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PRKD2Q9BZL6 878 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 EBF3Q9H4W6 596 aa19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 GREB1Q4ZG55 1949 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 EOMESO95936 686 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 HTR7P34969 479 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 SULT2A1Q06520 285 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIP10Q15642 601 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 SFT2D3Q587I9 215 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM26DQ5JW98 314 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 MSANTD2Q6P1R3 559 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 LGI2Q8N0V4 545 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 SPON2Q9BUD6 331 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 VWA7Q9Y334 891 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TLR5O60602 858 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 FKBP6O75344 327 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 BTKQ06187 659 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 LBRQ14739 615 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 KYQ8NBH2 561 aa19.48■□□□□ 0.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PHC3Q8NDX5 983 aa19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms