RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK13Q9HB14 408 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 LHX3Q9UBR4 397 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 FSBPO95073 299 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MT-CO1P00395 513 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CAMK1Q14012 370 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 DBN1Q16643 649 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 GPR158Q5T848 1215 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 CPXM2Q8N436 756 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.89■■□□□ 1.26
VSTM4-201ENST00000298454 K7ERQ8 282 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CPA3P15088 417 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RAB10P61026 200 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ACVR1Q04771 509 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF398Q8TD17 642 aa22.89■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 NMRAL1Q9HBL8 299 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 GRM6O15303 877 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC6O75061 913 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 STMN1P16949 149 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R39P59534 338 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RIN3Q8TB24 985 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ITM2AO43736 263 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CES1P23141 567 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SLC12A1Q13621 1099 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 TEAD2Q15562 447 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 MPPE1Q53F39 396 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SPNS2Q8IVW8 549 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 OMDQ99983 421 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 TASP1Q9H6P5 420 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 G3V2L1 256 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 MOSPD3O75425 235 aa22.87■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 THAP1Q9NVV9 213 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ACOT9Q9Y305 439 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 KITP10721 976 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SLC8A1P32418 973 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 POLD2P49005 469 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ARFIP2P53365 341 aa22.86■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 LAMB3Q13751 1172 aa22.86■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA6LQ8N4H0 392 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.86■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 PEX13Q92968 403 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 DCTN3O75935 186 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RHOP08100 348 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CD70P32970 193 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 GLRBP48167 497 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 EPHA5P54756 1037 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ITGA9Q13797 1035 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SETDB1Q15047 1291 aa22.86■■□□□ 1.25
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