RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 GABRB3P28472 473 aa22.98■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 CSNK1DP48730 415 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 ARSDP51689 593 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 MPP1Q00013 466 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 ACVR1Q04771 509 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 TDHQ8IZJ6 230 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 SMARCD2Q92925 531 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 PEX13Q92968 403 aa22.98■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 SMIM14Q96QK8 99 aa22.98■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 CYP17A1P05093 508 aa22.97■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 EML3Q32P44 896 aa22.97■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.97■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 ETV4P43268 484 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 CCT5P48643 541 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 TMPRSS15P98073 1019 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 TBATAQ96M53 351 aa22.96■■□□□ 1.27
PTX3-201ENST00000295927 SNX15Q9NRS6 342 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTX3-201ENST00000295927 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 GPR22Q99680 433 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PGLSO95336 258 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 PIGNO95427 931 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 TAC1P20366 129 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX3-201ENST00000295927 BCL2L1Q07817 233 aa22.94■■□□□ 1.26
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