RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 SLC28A1O00337 649 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GSSP48637 474 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RGS1Q08116 209 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 MTERF3Q96E29 417 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PWWP2AQ96N64 755 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SNX15Q9NRS6 342 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CLPTM1O96005 669 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 NFKBIEO00221 500 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 UGT2B4P06133 528 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 HTR7P34969 479 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PKNOX1P55347 436 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SQLEQ14534 574 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 POLD2P49005 469 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 BST1Q10588 318 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PMF1Q6P1K2 205 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PACS1Q6VY07 963 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CEP44Q9C0F1 390 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 REEP1Q9H902 201 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CCDC189A1A4V9 331 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 OR10H2O60403 315 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PSMB9P28065 219 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SLC34A1Q06495 639 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MREGQ8N565 214 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ZNF398Q8TD17 642 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PCED1BQ96HM7 432 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 C5orf60A6NFR6 353 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 EPORP19235 508 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 25
USP25-202ENST00000285681 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GPR156Q8NFN8 814 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 JAK1P23458 1154 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CENPTQ96BT3 561 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ENO4A6NNW6 628 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ACSL4O60488 711 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TSPAN8P19075 237 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 LIPMQ5VYY2 423 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MACC1Q6ZN28 852 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CEP68Q76N32 757 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TERB1Q8NA31 727 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CYLDQ9NQC7 956 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 LRCH4O75427 683 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PIAS1O75925 651 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 BIKQ13323 160 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CHST9Q7L1S5 443 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 OR10G6Q8NH81 332 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CD101Q93033 1021 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 HDAC3O15379 428 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SASH3O75995 380 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 NUDT17P0C025 328 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 HGFP14210 728 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 C21orf59P57076 290 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CRHR2Q13324 411 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TOMM20Q15388 145 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MON1BQ7L1V2 547 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 BTRCQ9Y297 605 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 A0A1W2PQ67 120 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 H0Y858 1186 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms