RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.06□□□□□ -0.64
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GGPS1-201ENST00000282841 TASP1Q9H6P5 420 aa11.06□□□□□ -0.64
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GGPS1-201ENST00000282841 CEP97Q8IW35 865 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 GPR65Q8IYL9 337 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 CENPTQ96BT3 561 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ABCG8Q9H221 673 aa11.04□□□□□ -0.64
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GGPS1-201ENST00000282841 VPS45Q9NRW7 570 aa11.04□□□□□ -0.64
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.04□□□□□ -0.64
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GGPS1-201ENST00000282841 SENP1Q9P0U3 644 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 STK39Q9UEW8 545 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 MAFFQ9ULX9 164 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.04□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 CYBBP04839 570 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 RB1P06400 928 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ARSAP15289 507 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 UBE3AQ05086 875 aa11.03□□□□□ -0.64
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