RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHPFQ8IZ52 775 aa20.54■□□□□ 0.88
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 MGME1Q9BQP7 344 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ST8SIA6P61647 398 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC14A2Q15849 920 aa20.53■□□□□ 0.88
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC20A2Q08357 652 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRYMQ14894 314 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMED2Q15363 201 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FRS2Q8WU20 508 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBK1Q9UHD2 729 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.52■□□□□ 0.88
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALDH1A2O94788 518 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.51■□□□□ 0.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SOX13Q9UN79 622 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM159BA6NKW6 160 aa20.51■□□□□ 0.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARMC3Q5W041 872 aa20.51■□□□□ 0.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SERPINF2P08697 491 aa20.5■□□□□ 0.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXO43Q4G163 708 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPHX1P07099 455 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CR2P20023 1033 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GKP32189 559 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCID2Q5JVF3 399 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPM1NQ8N819 430 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRN2Q92932 1015 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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