RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 KINO60870 393 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 PDCP20941 246 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 ABTB2Q8N961 1025 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 RLBP1P12271 317 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC192P0DO97 292 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 PDILTQ8N807 584 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 SMC2O95347 1197 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 TPM1P09493 284 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 TNMDQ9H2S6 317 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 IQGAP2Q13576 1575 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.45■□□□□ 0.54
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PTPRT-210ENST00000617474 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 KRT85P78386 507 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 OSCARQ8IYS5 282 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 CAMK4Q16566 473 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 NME9Q86XW9 330 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 IFT140Q96RY7 1462 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 MARCH6O60337 910 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 GPS2Q13227 327 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 USP25Q9UHP3 1055 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
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PTPRT-210ENST00000617474 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 FAM83GA6ND36 823 aa18.41■□□□□ 0.54
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PTPRT-210ENST00000617474 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.41■□□□□ 0.54
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PTPRT-210ENST00000617474 MX1P20591 662 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 ME1P48163 572 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 TESK2Q96S53 571 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 AACSQ86V21 672 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 PDRG1Q9NUG6 133 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 DDX11Q96FC9 970 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 STK38Q15208 465 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.54
PTPRT-210ENST00000617474 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 SPATA32Q96LK8 384 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 MYL6BP14649 208 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC61Q9Y6R9 512 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 VPS53Q5VIR6 699 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 OLFM4Q6UX06 510 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 EVA1CP58658 441 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 CBX1P83916 185 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 FYB1O15117 783 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRT-210ENST00000617474 MTMR7Q9Y216 660 aa18.34■□□□□ 0.53
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