RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACEP12821 1306 aa14.97□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.97□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.96□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.96□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIRT1Q96EB6 747 aa14.96□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.96□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.96□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.96□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TECPR2O15040 1411 aa14.96□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.96□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.95□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNAI1P63096 354 aa14.95□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.95□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFT57Q9NWB7 429 aa14.95□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP35Q9P2H5 1018 aa14.95□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF853P0CG23 659 aa14.94□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT24Q2M2I5 525 aa14.93□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMC5Q8IY18 1101 aa14.93□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LNPKQ9C0E8 428 aa14.93□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP44Q96MT7 982 aa14.93□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.93□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.92□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MCM10Q7L590 875 aa14.92□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPRUQ92729 1446 aa14.91□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.91□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EID1Q9Y6B2 187 aa14.9□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.9□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF428Q96B54 188 aa14.9□□□□□ -0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.89□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C3P01024 1663 aa14.89□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.89□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.89□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.89□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.88□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUCB1Q02818 461 aa14.88□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.88□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.88□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.88□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.88□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXO3O43524 673 aa14.87□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKAP12Q02952 1782 aa14.87□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP6P35125 1406 aa14.87□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITSN1Q15811 1721 aa14.87□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BECN1Q14457 450 aa14.87□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.87□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.86□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.86□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.86□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.85□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.85□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.85□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.85□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCC4O15439 1325 aa14.85□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTCH1Q13635 1447 aa14.84□□□□□ -0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHL1O00533 1208 aa14.82□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBX22Q9Y458 520 aa14.82□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIK3R4Q99570 1358 aa14.82□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GSE1Q14687 1217 aa14.82□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PEAK1Q9H792 1746 aa14.81□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNA6P17658 529 aa14.81□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMPHP49418 695 aa14.81□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NLRP6P59044 892 aa14.8□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.8□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP31Q70CQ4 1352 aa14.8□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSH2Q76I76 1423 aa14.8□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EYA1Q99502 592 aa14.8□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCC1Q96CN9 775 aa14.79□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.79□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC4A2P04920 1241 aa14.78□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.78□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APBB1O00213 710 aa14.77□□□□□ -0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C14orf37Q86TY3 774 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 G2E3Q7L622 706 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms