RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603544.5

KIAA0391-205, Transcript of KIAA0391, human

TSL 5 BASIC

Gene KIAA0391, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIAA0391-205	ENST00000603544	USP6	P35125	1406 aa		11.7	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		11.69	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	PEAK1	Q9H792	1746 aa		11.69	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	TBX22	Q9Y458	520 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.68	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	PTCH1	Q13635	1447 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	SSH2	Q76I76	1423 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	NEFM	P07197	916 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	DIP2A	Q14689	1571 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	AAMP	Q13685	434 aa		11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	SOX12	O15370	315 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.66	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIAA0391-205	ENST00000603544	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	VAMP4	O75379	141 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	NBR1	Q14596	966 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	KCNA6	P17658	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	SEC24B	O95487	1268 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	GNAI1	P63096	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	PIK3C2A	O00443	1686 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	USP19	O94966	1318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.61	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.6	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		11.59	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.59	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.59	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	MCM10	Q7L590	875 aa		11.59	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.59	□□□□□ -0.55
KIAA0391-205	ENST00000603544	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.58	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	PIK3R4	Q99570	1358 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	FOXO3	O43524	673 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	FLT4	P35916	1363 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	ARHGEF10	O15013	1369 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	NLRP6	P59044	892 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	ABCC4	O15439	1325 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	EYA1	Q99502	592 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	CHL1	O00533	1208 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	KDR	P35968	1356 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	CRB1	P82279	1406 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	AMPH	P49418	695 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.53	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		11.53	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.53	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	RGS12	O14924	1447 aa		11.53	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.52	□□□□□ -0.56
KIAA0391-205	ENST00000603544	HOXC9	P31274	260 aa		11.52	□□□□□ -0.57
KIAA0391-205	ENST00000603544	ABTB2	Q8N961	1025 aa		11.52	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms