RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 NLRP1Q9C000 1473 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CLCN6P51797 869 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 PDE3AQ14432 1141 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 AK7Q96M32 723 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 PHF12Q96QT6 1004 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CRBNQ96SW2 442 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CDK19Q9BWU1 502 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 FYB1O15117 783 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 PDE4AP27815 886 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 ADGRB2O60241 1585 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPOAP1O95153 1857 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 IL16Q14005 1332 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 PLIN1O60240 522 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 ZMYND15Q9H091 742 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 CPS1P31327 1500 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 MFSD10Q14728 455 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 CABP1Q9NZU7 370 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 METP08581 1390 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 FCHSD2O94868 740 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 MLECQ14165 292 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 IL27Q8NEV9 243 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-208ENST00000587914 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 IFNL1Q8IU54 200 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 BACH2Q9BYV9 841 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 BCAR3O75815 825 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF428Q96B54 188 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 SLIT1O75093 1534 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 NEFMP07197 916 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 CAMK2BQ13554 666 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 EID1Q9Y6B2 187 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 KIF12Q96FN5 646 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 POLKQ9UBT6 870 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 TBX22Q9Y458 520 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms