RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.23■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.23■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 PXDNQ92626 1479 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS3-204ENST00000575194 PDE3AQ14432 1141 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 BCAR3O75815 825 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 IL13P35225 146 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 PIK3C2AO00443 1686 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 SBNO1A3KN83 1393 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 RIPK4P57078 832 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 USP31Q70CQ4 1352 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 PRKAR2BP31323 418 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 ABTB2Q8N961 1025 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 ALS2Q96Q42 1657 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 FBLN1P23142 703 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 PIP4K2BP78356 416 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 USP54Q70EL1 1684 aa24.14■■□□□ 1.46
SPNS3-204ENST00000575194 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
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SPNS3-204ENST00000575194 NFE2L2Q16236 605 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 NLRP6P59044 892 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 AAMPQ13685 434 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 PEAK1Q9H792 1746 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 HMOX1P09601 288 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS3-204ENST00000575194 MS4A1P11836 297 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGEF10O15013 1369 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 PHLPP1O60346 1717 aa24.05■■□□□ 1.44
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SPNS3-204ENST00000575194 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 USP19O94966 1318 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 FLT4P35916 1363 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF428Q96B54 188 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SPNS3-204ENST00000575194 SLIT3O75094 1523 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 PANK1Q8TE04 598 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 IFT57Q9NWB7 429 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 GNAI1P63096 354 aa24■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 GCP02774 474 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 COG6Q9Y2V7 657 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 NFAT5O94916 1531 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 KIF16BQ96L93 1317 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 SOX12O15370 315 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SPNS3-204ENST00000575194 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 AMPHP49418 695 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 PLEKHG5O94827 1062 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 RTL1A6NKG5 1358 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF853P0CG23 659 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 ABCA3Q99758 1704 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 RLBP1P12271 317 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS3-204ENST00000575194 HSPA1LP34931 641 aa23.91■■□□□ 1.42
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