RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
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CTDNEP1-210ENST00000574322 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXO41Q8TF61 875 aa37.13■■■■□ 3.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRKAR2BP31323 418 aa37.11■■■■□ 3.53
CTDNEP1-210ENST00000574322 KRT28Q7Z3Y7 464 aa37.11■■■■□ 3.53
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF24Q5T7B8 1368 aa37.11■■■■□ 3.53
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP3K19Q56UN5 1328 aa37.08■■■■□ 3.53
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IP6K1Q92551 441 aa36.79■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF853P0CG23 659 aa36.76■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GCP02774 474 aa36.71■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CANXP27824 592 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
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