RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 BRINP3Q76B58 766 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 USP32Q8NFA0 1604 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 ACEP12821 1306 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 OCEL1Q9H607 264 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 SOX12O15370 315 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 ANP32CO43423 234 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 OTUD5Q96G74 571 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 STK24Q9Y6E0 443 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 FOXO3O43524 673 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 NME9Q86XW9 330 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GINS3-210ENST00000568468 PHLPP1O60346 1717 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 POTEJP0CG39 1038 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 MFRPQ9BY79 579 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 USP6P35125 1406 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 JCADQ9P266 1359 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 FBLN1P23142 703 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 PSME1Q06323 249 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 FYB1O15117 783 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 CCDC184Q52MB2 194 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 PXDNQ92626 1479 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 KIF1AQ12756 1690 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 MORC1Q86VD1 984 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 SHPRHQ149N8 1683 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 ITSN1Q15811 1721 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 SSH2Q76I76 1423 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 AKAP12Q02952 1782 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 ABTB2Q8N961 1025 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 COG3Q96JB2 828 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 LRP6O75581 1613 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS3-210ENST00000568468 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 PPP2R1AP30153 589 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 NLRP6P59044 892 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 RALBP1Q15311 655 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 SBNO1A3KN83 1393 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 MRS2Q9HD23 443 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 NSD2O96028 1365 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-210ENST00000568468 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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