RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.7■■■□□ 2.19
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RCCD1-208ENST00000557266 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
RCCD1-208ENST00000557266 COG3Q96JB2 828 aa28.67■■■□□ 2.18
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF428Q96B54 188 aa28.67■■■□□ 2.18
RCCD1-208ENST00000557266 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.66■■■□□ 2.18
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RCCD1-208ENST00000557266 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.65■■■□□ 2.18
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RCCD1-208ENST00000557266 GNAI1P63096 354 aa28.61■■■□□ 2.17
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RCCD1-208ENST00000557266 EID1Q9Y6B2 187 aa28.54■■■□□ 2.16
RCCD1-208ENST00000557266 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
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RCCD1-208ENST00000557266 PEAK1Q9H792 1746 aa28.41■■■□□ 2.14
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RCCD1-208ENST00000557266 SOX12O15370 315 aa28.31■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 RGS12O14924 1447 aa28.31■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 KIAA0232Q92628 1395 aa28.3■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.29■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.29■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
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