RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556726.5

CCDC88C-211, Transcript of coiled-coil domain containing 88C, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC88C, Length 3,617 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88C-211ENST00000556726 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 SIL1Q9H173 461 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.83□□□□□ -0.04
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CCDC88C-211ENST00000556726 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 MYOM2P54296 1465 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 TTC22Q5TAA0 569 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 SRGAP3O43295 1099 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 FOSBP53539 338 aa14.81□□□□□ -0.04
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CCDC88C-211ENST00000556726 NUCB2P80303 420 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC88C-211ENST00000556726 TET3O43151 1660 aa14.81□□□□□ -0.04
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