RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533099.5

RNPC3-208, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RNPC3, Length 3,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-208ENST00000533099 BMP2KLQ5H9B9 411 aa10.05□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.05□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 FOXO3O43524 673 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 RABEP1Q15276 862 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 FBXW7Q969H0 707 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 SDSP20132 328 aa10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 ERVK-7P63135 1459 aa10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 ATP10AO60312 1499 aa10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 ANXA1P04083 346 aa10.02□□□□□ -0.8
RNPC3-208ENST00000533099 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.02□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa10.02□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PTMSP20962 102 aa10.01□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.01□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.01□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ERC2O15083 957 aa10.01□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 NLRP6P59044 892 aa10.01□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 SPC24Q8NBT2 197 aa10.01□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.01□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PPFIA3O75145 1194 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CCDC173Q0VFZ6 552 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CLCN1P35523 988 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 G2E3Q7L622 706 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 RAB3GAP1Q15042 981 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 FERMT3Q86UX7 667 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 OSCARQ8IYS5 282 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 FAM177BA6PVY3 158 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 TTC22Q5TAA0 569 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CFAP44Q96MT7 982 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 IFT57Q9NWB7 429 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ABCA8O94911 1581 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 GNAI2P04899 355 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ERBB4Q15303 1308 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CD109Q6YHK3 1445 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 STK3Q13188 491 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 SIL1Q9H173 461 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 SPG7Q9UQ90 795 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ABCC11Q96J66 1382 aa9.98□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CPA1P15085 419 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 UQCRHP07919 91 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 KDM4AO75164 1064 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 RBSNQ9H1K0 784 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 USP25Q9UHP3 1055 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 SRGAP3O43295 1099 aa9.96□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.96□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF592Q92610 1267 aa9.96□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.96□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 TEFQ10587 303 aa9.96□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 TMX3Q96JJ7 454 aa9.96□□□□□ -0.81
RNPC3-208ENST00000533099 KLHL40Q2TBA0 621 aa9.96□□□□□ -0.82
RNPC3-208ENST00000533099 ZMYND15Q9H091 742 aa9.96□□□□□ -0.82
RNPC3-208ENST00000533099 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.96□□□□□ -0.82
RNPC3-208ENST00000533099 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms