RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 SBNO1A3KN83 1393 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 FLT4P35916 1363 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 USP54Q70EL1 1684 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 PLIN1O60240 522 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 DCCP43146 1447 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-228ENST00000515737 MST1RQ04912 1400 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-228ENST00000515737 NFE2L2Q16236 605 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-228ENST00000515737 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-228ENST00000515737 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-228ENST00000515737 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-228ENST00000515737 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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SH3BP2-228ENST00000515737 MSH6P52701 1360 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP2-228ENST00000515737 FBXO41Q8TF61 875 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-228ENST00000515737 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.98■■□□□ 1.11
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SH3BP2-228ENST00000515737 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.95■■□□□ 1.11
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SH3BP2-228ENST00000515737 BCAR3O75815 825 aa21.95■■□□□ 1.1
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SH3BP2-228ENST00000515737 IP6K1Q92551 441 aa21.91■■□□□ 1.1
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SH3BP2-228ENST00000515737 MCM10Q7L590 875 aa21.8■■□□□ 1.08
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SH3BP2-228ENST00000515737 PXDNQ92626 1479 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-228ENST00000515737 PDE3AQ14432 1141 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-228ENST00000515737 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-228ENST00000515737 CERKQ8TCT0 537 aa21.79■■□□□ 1.08
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SH3BP2-228ENST00000515737 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.75■■□□□ 1.07
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SH3BP2-228ENST00000515737 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 RGPD5Q99666 1765 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 VAMP4O75379 141 aa21.72■■□□□ 1.07
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