RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 NEUROD2Q15784 382 aa7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 NCAPD2Q15021 1401 aa7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 RAB11FIP3O75154 756 aa7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 DCCP43146 1447 aa7.21□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 EVA1CP58658 441 aa7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 KIAA0232Q92628 1395 aa7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 NRDCO43847 1150 aa7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 RNF20Q5VTR2 975 aa7.2□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ERBB4Q15303 1308 aa7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ALKQ9UM73 1620 aa7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 24.5
POLK-215ENST00000514141 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 PRKAR2BP31323 418 aa7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 PPLO60437 1756 aa7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 USP31Q70CQ4 1352 aa7.19□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 IGSF3O75054 1194 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 PHF14O94880 888 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 A0A087WZG4 1122 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 HYPKQ9NX55 129 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ITSN1Q15811 1721 aa7.18□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.17□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 PIK3C2BO00750 1634 aa7.17□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 SLIT1O75093 1534 aa7.17□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PP64 1363 aa7.17□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 CPS1P31327 1500 aa7.17□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 GNAI2P04899 355 aa7.17□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 KLHL34Q8N239 644 aa7.17□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 PTPRUQ92729 1446 aa7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 CDC45O75419 566 aa7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ALDH1L1O75891 902 aa7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ACEP12821 1306 aa7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 NT5C2P49902 561 aa7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.16□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 KCNJ4P48050 445 aa7.15□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.15□□□□□ -1.26
POLK-215ENST00000514141 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 FYB1O15117 783 aa7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 NUCB2P80303 420 aa7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 IP6K1Q92551 441 aa7.15□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PSMA5P28066 241 aa7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 AOX1Q06278 1338 aa7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 RGS12O14924 1447 aa7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 TOM1O60784 492 aa7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.14□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ANKRD1Q15327 319 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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