RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
HOXB3-212ENST00000498678 FLT4P35916 1363 aa34.1■■■■□ 3.05
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HOXB3-212ENST00000498678 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
HOXB3-212ENST00000498678 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
HOXB3-212ENST00000498678 RRP1P56182 461 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM35Q9UPQ4 493 aa34.08■■■■□ 3.05
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HOXB3-212ENST00000498678 RIPK4P57078 832 aa34.05■■■■□ 3.04
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HOXB3-212ENST00000498678 SULT6B1Q6IMI4 303 aa33.99■■■■□ 3.03
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HOXB3-212ENST00000498678 KCNH5Q8NCM2 988 aa33.98■■■■□ 3.03
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HOXB3-212ENST00000498678 PLIN1O60240 522 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXB3-212ENST00000498678 ALS2Q96Q42 1657 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXB3-212ENST00000498678 IP6K1Q92551 441 aa33.89■■■■□ 3.02
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HOXB3-212ENST00000498678 BRINP3Q76B58 766 aa33.86■■■■□ 3.01
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HOXB3-212ENST00000498678 LMOD3Q0VAK6 560 aa33.82■■■■□ 3
HOXB3-212ENST00000498678 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
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HOXB3-212ENST00000498678 BCAR3O75815 825 aa33.81■■■■□ 3
HOXB3-212ENST00000498678 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.79■■■■□ 3
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HOXB3-212ENST00000498678 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
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HOXB3-212ENST00000498678 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
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HOXB3-212ENST00000498678 ZNF853P0CG23 659 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXB3-212ENST00000498678 DCTN1Q14203 1278 aa33.71■■■□□ 2.99
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HOXB3-212ENST00000498678 NBPF4Q96M43 638 aa33.7■■■□□ 2.98
HOXB3-212ENST00000498678 CRBNQ96SW2 442 aa33.7■■■□□ 2.98
HOXB3-212ENST00000498678 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
HOXB3-212ENST00000498678 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
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HOXB3-212ENST00000498678 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.68■■■□□ 2.98
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HOXB3-212ENST00000498678 ERICH6Q7L0X2 663 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-212ENST00000498678 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-212ENST00000498678 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-212ENST00000498678 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.64■■■□□ 2.98
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HOXB3-212ENST00000498678 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
HOXB3-212ENST00000498678 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
HOXB3-212ENST00000498678 CRB1P82279 1406 aa33.57■■■□□ 2.96
HOXB3-212ENST00000498678 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.57■■■□□ 2.96
HOXB3-212ENST00000498678 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
HOXB3-212ENST00000498678 CANXP27824 592 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
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