RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.52■■□□□ 1.2
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.5■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF1AQ12756 1690 aa22.5■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGEF10O15013 1369 aa22.5■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AMPHP49418 695 aa22.49■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.49■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PDE3AQ14432 1141 aa22.49■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PSME1Q06323 249 aa22.48■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.47■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.46■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.46■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RTL1A6NKG5 1358 aa22.45■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.43■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LTN1O94822 1766 aa22.43■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCCP43146 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.43■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GNAI1P63096 354 aa22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IFT57Q9NWB7 429 aa22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.41■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HOXC9P31274 260 aa22.4■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MS4A1P11836 297 aa22.4■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ORAI2Q96SN7 254 aa22.4■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.4■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDRP35968 1356 aa22.39■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM94Q12767 1356 aa22.39■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NFAT5O94916 1531 aa22.39■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF428Q96B54 188 aa22.39■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATF3P18847 181 aa22.39■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AAMPQ13685 434 aa22.38■■□□□ 1.17
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HSPA2P54652 639 aa22.37■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.37■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.37■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.36■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FOXO3O43524 673 aa22.36■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.36■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFAP44Q96MT7 982 aa22.36■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF853P0CG23 659 aa22.35■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.35■■□□□ 1.17
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 EYA1Q99502 592 aa22.35■■□□□ 1.17
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.34■■□□□ 1.17
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF16BQ96L93 1317 aa22.34■■□□□ 1.17
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.32■■□□□ 1.16
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IP6K1Q92551 441 aa22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COG6Q9Y2V7 657 aa22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STRCQ7RTU9 1775 aa22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MBIPQ9NS73 344 aa22.31■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MSH6P52701 1360 aa22.31■■□□□ 1.16
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM83GA6ND36 823 aa22.3■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.3■■□□□ 1.16
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP19O94966 1318 aa22.28■■□□□ 1.16
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCTN1Q14203 1278 aa22.28■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.27■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GCP02774 474 aa22.26■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.26■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VAMP4O75379 141 aa22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RLBP1P12271 317 aa22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MCM10Q7L590 875 aa22.24■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.24■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM27P14373 513 aa22.24■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.23■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.23■■□□□ 1.15
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