RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447061.2

GAPDHP25-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP25, Length 1,001 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP25-201ENST00000447061 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 RASEFQ8IZ41 740 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 FBXO3Q9UK99 471 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 PIK3C2AO00443 1686 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 NLRP13Q86W25 1043 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 USP19O94966 1318 aa7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 ABTB2Q8N961 1025 aa7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 SLIT3O75094 1523 aa7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 ABCC6O95255 1503 aa7.37□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 ABCA3Q99758 1704 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 FYB1O15117 783 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 HSPA1LP34931 641 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 NUBP1P53384 320 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 NLRP6P59044 892 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 COG3Q96JB2 828 aa7.35□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 CPDO75976 1380 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 NFAT5O94916 1531 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 NME9Q86XW9 330 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP25-201ENST00000447061 GCP02774 474 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 RALBP1Q15311 655 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 KIF12Q96FN5 646 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 LTN1O94822 1766 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 RTL1A6NKG5 1358 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 POTEB2H3BUK9 544 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 MORC1Q86VD1 984 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 COL18A1P39060 1754 aa7.31□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.3□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.3□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.3□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 INSRP06213 1382 aa7.3□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.29□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 MAP3K13O43283 966 aa7.29□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 ANP32CO43423 234 aa7.29□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 FLT4P35916 1363 aa7.29□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 KIAA0232Q92628 1395 aa7.29□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.28□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 RGPD5Q99666 1765 aa7.28□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 SLIT2O94813 1529 aa7.28□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.28□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 IP6K1Q92551 441 aa7.28□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.28□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 POLKQ9UBT6 870 aa7.28□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.27□□□□□ -1.24
GAPDHP25-201ENST00000447061 LRP6O75581 1613 aa7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 AMPHP49418 695 aa7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 FAM212AQ96EL1 285 aa7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 CFAP53Q96M91 514 aa7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 NRAPQ86VF7 1730 aa7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 PEAK1Q9H792 1746 aa7.27□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 FAM83GA6ND36 823 aa7.26□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 C7P10643 843 aa7.26□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 PPP2R1AP30153 589 aa7.26□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 HOXC9P31274 260 aa7.26□□□□□ -1.25
GAPDHP25-201ENST00000447061 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms