RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.12■□□□□ 0.81
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SHQ1-202ENST00000444040 KDRP35968 1356 aa20.03■□□□□ 0.8
SHQ1-202ENST00000444040 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SHQ1-202ENST00000444040 DCTPP1Q9H773 170 aa20.02■□□□□ 0.8
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SHQ1-202ENST00000444040 ATP10DQ9P241 1426 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-202ENST00000444040 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.01■□□□□ 0.79
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