RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429368.1

MEG9-201, Transcript of maternally expressed 9, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MEG9, Length 2,638 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG9-201ENST00000429368 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.28■□□□□ 0.84
MEG9-201ENST00000429368 RIPK4P57078 832 aa20.28■□□□□ 0.84
MEG9-201ENST00000429368 PLEKHG5O94827 1062 aa20.27■□□□□ 0.84
MEG9-201ENST00000429368 WDR63Q8IWG1 891 aa20.27■□□□□ 0.84
MEG9-201ENST00000429368 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 ATF3P18847 181 aa20.25■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 AMPHP49418 695 aa20.24■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.23■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 MST1RQ04912 1400 aa20.23■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 SBNO1A3KN83 1393 aa20.23■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.23■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 BCAR3O75815 825 aa20.22■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.22■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 FLT4P35916 1363 aa20.22■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.22■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.21■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.21■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MEG9-201ENST00000429368 HOXC9P31274 260 aa20.2■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 NFE2L2Q16236 605 aa20.2■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 USP54Q70EL1 1684 aa20.2■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.18■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 NEFMP07197 916 aa20.18■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 EYA1Q99502 592 aa20.18■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.17■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.17■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.17■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 DCCP43146 1447 aa20.16■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 FAM83GA6ND36 823 aa20.16■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 MSH6P52701 1360 aa20.16■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.16■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 NFAT5O94916 1531 aa20.15■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 DCTN1Q14203 1278 aa20.14■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 CRBNQ96SW2 442 aa20.14■□□□□ 0.82
MEG9-201ENST00000429368 GCP02774 474 aa20.14■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 KIF1AQ12756 1690 aa20.13■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 LTN1O94822 1766 aa20.12■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.12■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.12■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 ARHGEF10O15013 1369 aa20.12■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.12■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 IL16Q14005 1332 aa20.11■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.1■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.1■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 IP6K1Q92551 441 aa20.1■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.1■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 BRINP3Q76B58 766 aa20.09■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 USP19O94966 1318 aa20.09■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 KDRP35968 1356 aa20.09■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.08■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 SKAP1Q86WV1 359 aa20.08■□□□□ 0.81
MEG9-201ENST00000429368 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 SLIT3O75094 1523 aa20.08■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.07■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 RTL1A6NKG5 1358 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 MCM10Q7L590 875 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 ALS2Q96Q42 1657 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 NBPF4Q96M43 638 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 SLAIN2Q9P270 581 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 TNNQ9UQP3 1299 aa20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 ZNF853P0CG23 659 aa20.04■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.04■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 MBIPQ9NS73 344 aa20.04■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 PXDNQ92626 1479 aa20.04■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.03■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 PANK1Q8TE04 598 aa20.03■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 IFT57Q9NWB7 429 aa20.02■□□□□ 0.8
MEG9-201ENST00000429368 TSPYL6Q8N831 410 aa20.02■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.01■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 GNAI1P63096 354 aa20.01■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 CFAP44Q96MT7 982 aa20.01■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.01■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 TNS3Q68CZ2 1445 aa20■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 CANXP27824 592 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 RLBP1P12271 317 aa19.99■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.99■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.98■□□□□ 0.79
MEG9-201ENST00000429368 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms