RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.98■■□□□ 1.43
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF428Q96B54 188 aa23.92■■□□□ 1.42
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF853P0CG23 659 aa23.91■■□□□ 1.42
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.9■■□□□ 1.42
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MBIPQ9NS73 344 aa23.88■■□□□ 1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.88■■□□□ 1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.88■■□□□ 1.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.88■■□□□ 1.41
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP54Q70EL1 1684 aa23.8■■□□□ 1.4
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC4O15439 1325 aa23.72■■□□□ 1.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHL1O00533 1208 aa23.71■■□□□ 1.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMC5Q8IY18 1101 aa23.71■■□□□ 1.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EYA1Q99502 592 aa23.7■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRB1P82279 1406 aa23.7■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.69■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABTB2Q8N961 1025 aa23.69■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.69■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.69■■□□□ 1.38
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA0232Q92628 1395 aa23.68■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP19O94966 1318 aa23.67■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC24BO95487 1268 aa23.67■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXC9P31274 260 aa23.67■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBR1Q14596 966 aa23.67■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXO3O43524 673 aa23.66■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NWD1Q149M9 1564 aa23.66■■□□□ 1.38
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