RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424748.1

PCBP1-AS1-221, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PRKAR2BP31323 418 aa14.87□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.87□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 SLAIN2Q9P270 581 aa14.86□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ARHGEF10O15013 1369 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 HOXC9P31274 260 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 RIPK4P57078 832 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 NFE2L2Q16236 605 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 IP6K1Q92551 441 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 IL16Q14005 1332 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 GCP02774 474 aa14.84□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 HMOX1P09601 288 aa14.84□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.84□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.83□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 USP19O94966 1318 aa14.83□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.83□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 BRINP3Q76B58 766 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 SLIT3O75094 1523 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.81□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 NFAT5O94916 1531 aa14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PEAK1Q9H792 1746 aa14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.78□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 EYA1Q99502 592 aa14.78□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.78□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 KDRP35968 1356 aa14.77□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.77□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PXDNQ92626 1479 aa14.76□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 GNAI1P63096 354 aa14.76□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ALS2Q96Q42 1657 aa14.76□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.75□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.75□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 IFT57Q9NWB7 429 aa14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ZNF428Q96B54 188 aa14.73□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 LTN1O94822 1766 aa14.73□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ABCC6O95255 1503 aa14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PLEKHG5O94827 1062 aa14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CPDO75976 1380 aa14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.71□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.71□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 TOM1O60784 492 aa14.7□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 MS4A1P11836 297 aa14.7□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CFAP44Q96MT7 982 aa14.7□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 NBPF4Q96M43 638 aa14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ERBB3P21860 1342 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ZNF853P0CG23 659 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 PDE3AQ14432 1141 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 MAP3K5Q99683 1374 aa14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 KIAA0232Q92628 1395 aa14.64□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 AAMPQ13685 434 aa14.64□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.64□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.64□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-221ENST00000424748 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms