RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD1Q15327 319 aa19■□□□□ 0.63
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SH3BP4-203ENST00000409212 GNAT3A8MTJ3 354 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 TRAK2O60296 914 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 NCOA1Q15788 1441 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 SRGAP3O43295 1099 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 MYL6BP14649 208 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 ABCC11Q96J66 1382 aa18.99■□□□□ 0.63
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SH3BP4-203ENST00000409212 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-203ENST00000409212 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.98■□□□□ 0.63
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SH3BP4-203ENST00000409212 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP4-203ENST00000409212 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP4-203ENST00000409212 IFT57Q9NWB7 429 aa18.95■□□□□ 0.62
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SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 STK38Q15208 465 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP2B1P20020 1258 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 IDI1Q13907 227 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.93■□□□□ 0.62
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SH3BP4-203ENST00000409212 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 FIBPO43427 364 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 TXLNAP40222 546 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
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SH3BP4-203ENST00000409212 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM5Q9C035 493 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPY26PQ9H489 355 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 KRT32Q14532 448 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 NME9Q86XW9 330 aa18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4-203ENST00000409212 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
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SH3BP4-203ENST00000409212 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 MCM10Q7L590 875 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 MNS1Q8NEH6 495 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 KDM4AO75164 1064 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
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SH3BP4-203ENST00000409212 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 EPS15P42566 896 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 NSD2O96028 1365 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 KRT85P78386 507 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 RAB11FIP3O75154 756 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 FILIP1LQ4L180 1135 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-203ENST00000409212 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
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