RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 IFT57Q9NWB7 429 aa29.28■■■□□ 2.28
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RABGGTA-202ENST00000399409 SMC5Q8IY18 1101 aa29.27■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 C3P01024 1663 aa29.27■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
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RABGGTA-202ENST00000399409 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.84■■■□□ 2.21
RABGGTA-202ENST00000399409 SNX21Q969T3 373 aa28.83■■■□□ 2.21
RABGGTA-202ENST00000399409 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.83■■■□□ 2.21
RABGGTA-202ENST00000399409 DCTPP1Q9H773 170 aa28.82■■■□□ 2.2
RABGGTA-202ENST00000399409 RGS12O14924 1447 aa28.82■■■□□ 2.2
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