RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389416.8

PTPRN2-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-202ENST00000389416 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 SIL1Q9H173 461 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 IFT57Q9NWB7 429 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 POLKQ9UBT6 870 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN2-202ENST00000389416 NPATQ14207 1427 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 ABCC11Q96J66 1382 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 WASHC4Q2M389 1173 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 LTKP29376 864 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 SRGAP3O43295 1099 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 F6X3S4 739 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 EXOC5O00471 708 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 GCC1Q96CN9 775 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 FSD1Q9BTV5 496 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 A0A1W2PP64 1363 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 TOM1O60784 492 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 STARD3NLO95772 234 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 ORAI2Q96SN7 254 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 CDC45O75419 566 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC27Q2M243 656 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 RNF20Q5VTR2 975 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 KIF3AQ9Y496 699 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2-202ENST00000389416 GCP02774 474 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 RAD21O60216 631 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 TRDNQ13061 729 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 MBIPQ9NS73 344 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 CNTROBQ8N137 903 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 ABCC1P33527 1531 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 H3BQV1 296 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 ANXA1P04083 346 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 IFFO2Q5TF58 517 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 MPHOSPH8Q99549 860 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 TRIM27P14373 513 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 MYD88Q99836 296 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 TSPOAP1O95153 1857 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 CPLX1O14810 134 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 FLIIQ13045 1269 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 MCTP1Q6DN14 999 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2-202ENST00000389416 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms