RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 RIPK4P57078 832 aa35.76■■■■□ 3.32
MSRB2-201ENST00000376510 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.76■■■■□ 3.32
MSRB2-201ENST00000376510 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
MSRB2-201ENST00000376510 MSH6P52701 1360 aa35.75■■■■□ 3.31
MSRB2-201ENST00000376510 MST1RQ04912 1400 aa35.73■■■■□ 3.31
MSRB2-201ENST00000376510 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.73■■■■□ 3.31
MSRB2-201ENST00000376510 MYH16Q9H6N6 1097 aa35.72■■■■□ 3.31
MSRB2-201ENST00000376510 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.71■■■■□ 3.31
MSRB2-201ENST00000376510 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.71■■■■□ 3.31
MSRB2-201ENST00000376510 NFE2L2Q16236 605 aa35.69■■■■□ 3.3
MSRB2-201ENST00000376510 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
MSRB2-201ENST00000376510 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.68■■■■□ 3.3
MSRB2-201ENST00000376510 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.68■■■■□ 3.3
MSRB2-201ENST00000376510 SULT6B1Q6IMI4 303 aa35.67■■■■□ 3.3
MSRB2-201ENST00000376510 IL16Q14005 1332 aa35.65■■■■□ 3.3
MSRB2-201ENST00000376510 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
MSRB2-201ENST00000376510 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
MSRB2-201ENST00000376510 HOXC9P31274 260 aa35.63■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.63■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 RGPD1P0DJD0 1748 aa35.63■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF10O15013 1369 aa35.62■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 RTL1A6NKG5 1358 aa35.6■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.6■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 AEBP1Q8IUX7 1158 aa35.6■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 LTN1O94822 1766 aa35.59■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 PLIN1O60240 522 aa35.59■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 NFAT5O94916 1531 aa35.58■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
MSRB2-201ENST00000376510 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.56■■■■□ 3.28
MSRB2-201ENST00000376510 IP6K1Q92551 441 aa35.54■■■■□ 3.28
MSRB2-201ENST00000376510 GCP02774 474 aa35.53■■■■□ 3.28
MSRB2-201ENST00000376510 EYA1Q99502 592 aa35.53■■■■□ 3.28
MSRB2-201ENST00000376510 SLIT3O75094 1523 aa35.53■■■■□ 3.28
MSRB2-201ENST00000376510 IGSF1Q8N6C5 1336 aa35.52■■■■□ 3.28
MSRB2-201ENST00000376510 FANCIQ9NVI1 1328 aa35.52■■■■□ 3.28
MSRB2-201ENST00000376510 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.51■■■■□ 3.28
MSRB2-201ENST00000376510 USP19O94966 1318 aa35.5■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.5■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa35.5■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 EXOC6Q8TAG9 804 aa35.5■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 ALS2Q96Q42 1657 aa35.49■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 BCAR3O75815 825 aa35.48■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 KDRP35968 1356 aa35.48■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 PLEKHG5O94827 1062 aa35.48■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC136Q96JN2 1154 aa35.46■■■■□ 3.27
MSRB2-201ENST00000376510 RARSP54136 660 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.44■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 GNAI1P63096 354 aa35.43■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 SLAIN2Q9P270 581 aa35.43■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 BRINP3Q76B58 766 aa35.42■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 CRBNQ96SW2 442 aa35.41■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 IFT57Q9NWB7 429 aa35.41■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 CANXP27824 592 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 C20orf194Q5TEA3 1177 aa35.39■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.39■■■■□ 3.26
MSRB2-201ENST00000376510 PXDNQ92626 1479 aa35.38■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 GAS2L2Q8NHY3 880 aa35.37■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 FAM83GA6ND36 823 aa35.36■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.35■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 CFAP44Q96MT7 982 aa35.34■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 DCTN1Q14203 1278 aa35.34■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF853P0CG23 659 aa35.33■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
MSRB2-201ENST00000376510 PDE3AQ14432 1141 aa35.32■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 NBPF6Q5VWK0 638 aa35.29■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 USHBP1Q8N6Y0 703 aa35.29■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 NBPF4Q96M43 638 aa35.29■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 BCL2L13Q9BXK5 485 aa35.29■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 MBIPQ9NS73 344 aa35.29■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.28■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 MCM10Q7L590 875 aa35.27■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 SMC4Q9NTJ3 1288 aa35.27■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF428Q96B54 188 aa35.26■■■■□ 3.24
MSRB2-201ENST00000376510 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
MSRB2-201ENST00000376510 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
MSRB2-201ENST00000376510 RGPD2P0DJD1 1756 aa35.23■■■■□ 3.23
MSRB2-201ENST00000376510 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.22■■■■□ 3.23
MSRB2-201ENST00000376510 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.22■■■■□ 3.23
MSRB2-201ENST00000376510 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.22■■■■□ 3.23
MSRB2-201ENST00000376510 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.22■■■■□ 3.23
MSRB2-201ENST00000376510 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.21■■■■□ 3.23
MSRB2-201ENST00000376510 RGPD5Q99666 1765 aa35.19■■■■□ 3.22
MSRB2-201ENST00000376510 MS4A1P11836 297 aa35.19■■■■□ 3.22
MSRB2-201ENST00000376510 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa35.19■■■■□ 3.22
MSRB2-201ENST00000376510 CHL1O00533 1208 aa35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms