RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366472.5

SH3BP5L-201, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5L, Length 3,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-201ENST00000366472 PIK3C2GO75747 1445 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP5L-201ENST00000366472 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP5L-201ENST00000366472 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP5L-201ENST00000366472 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 UGGT1Q9NYU2 1555 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 SMC5Q8IY18 1101 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 TSPYL6Q8N831 410 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 PLA2R1Q13018 1463 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 INSRP06213 1382 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCDC27Q2M243 656 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 KLHL40Q2TBA0 621 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 TERF2IPQ9NYB0 399 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 BMP2KLQ5H9B9 411 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 DRC7Q8IY82 874 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 CBX1P83916 185 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 RABEP1Q15276 862 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 FAM83GA6ND36 823 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 IGSF3O75054 1194 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 GCC1Q96CN9 775 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 SPC24Q8NBT2 197 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 GLI2P10070 1586 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 OFD1O75665 1012 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 SNX21Q969T3 373 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP5L-201ENST00000366472 LTKP29376 864 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF428Q96B54 188 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 REC8O95072 547 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 MCCP23508 829 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 CABP1Q9NZU7 370 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 KRT24Q2M2I5 525 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 NUTM2GQ5VZR2 741 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 USP25Q9UHP3 1055 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 FIBPO43427 364 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 ABCA6Q8N139 1617 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 MAST1Q9Y2H9 1570 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 TSPY26PQ9H489 355 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 KCNJ4P48050 445 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF592Q92610 1267 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP5L-201ENST00000366472 SDSP20132 328 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 GNAI1P63096 354 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 F6X3S4 739 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 TMEM63CQ9P1W3 806 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 A0A0G2JS52 829 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 PIP4K2BP78356 416 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 ATF3P18847 181 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 ESCO1Q5FWF5 840 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 STAC3Q96MF2 364 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.6 ms