RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 APAF1O14727 1248 aa22.9■■□□□ 1.26
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CLDN4-201ENST00000340958 ARHGEF10O15013 1369 aa22.89■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.88■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.88■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 NEFMP07197 916 aa22.87■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 ADAMTS2O95450 1211 aa22.87■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.86■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.86■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 IL13P35225 146 aa22.86■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 PDE3BQ13370 1112 aa22.85■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.85■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 NEUROD2Q15784 382 aa22.85■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.85■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.85■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 NGEFQ8N5V2 710 aa22.84■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 FLT4P35916 1363 aa22.84■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.83■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 C8orf37Q96NL8 207 aa22.83■■□□□ 1.25
CLDN4-201ENST00000340958 FCHSD2O94868 740 aa22.82■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.82■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 HMOX1P09601 288 aa22.82■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 USP54Q70EL1 1684 aa22.81■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 GCP02774 474 aa22.8■■□□□ 1.24
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CLDN4-201ENST00000340958 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 HOXC9P31274 260 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 GOLGA2Q08379 1002 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 PEAK1Q9H792 1746 aa22.77■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 POTEAQ6S8J7 498 aa22.77■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.77■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 NGLY1Q96IV0 654 aa22.77■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.77■■□□□ 1.24
CLDN4-201ENST00000340958 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 USP19O94966 1318 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLDN4-201ENST00000340958 RTL1A6NKG5 1358 aa22.75■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 NEFLP07196 543 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 IP6K1Q92551 441 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 NFAT5O94916 1531 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 WWC1Q8IX03 1113 aa22.73■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CLDN4-201ENST00000340958 SLIT3O75094 1523 aa22.72■■□□□ 1.23
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CLDN4-201ENST00000340958 ZNF521Q96K83 1311 aa22.72■■□□□ 1.23
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CLDN4-201ENST00000340958 SLIT2O94813 1529 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 CCDC27Q2M243 656 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 USP21Q9UK80 565 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.69■■□□□ 1.22
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CLDN4-201ENST00000340958 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 E9PSI1 815 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 EYA1Q99502 592 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 FAM83GA6ND36 823 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 SLFN5Q08AF3 891 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 NFE2L2Q16236 605 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 WDR63Q8IWG1 891 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 KIAA0232Q92628 1395 aa22.65■■□□□ 1.22
CLDN4-201ENST00000340958 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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CLDN4-201ENST00000340958 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.64■■□□□ 1.22
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CLDN4-201ENST00000340958 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.62■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.62■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.61■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.61■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.61■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 CHRNA2Q15822 529 aa22.61■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.6■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 FKBP8Q14318 412 aa22.6■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.6■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 CPDO75976 1380 aa22.6■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 RXRBP28702 533 aa22.59■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.59■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 BTG4Q9NY30 223 aa22.59■■□□□ 1.21
CLDN4-201ENST00000340958 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.59■■□□□ 1.21
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