RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 SSFA2P28290 1259 aa14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 IL16Q14005 1332 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 USP32Q8NFA0 1604 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 ERBB4Q15303 1308 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 KIF2CQ99661 725 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 VAMP4O75379 141 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 POLKQ9UBT6 870 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-201ENST00000324659 FCHSD2O94868 740 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 ABCC3O15438 1527 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 MBIPQ9NS73 344 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 SNX21Q969T3 373 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 COG3Q96JB2 828 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 NFE2L2Q16236 605 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 GCC1Q96CN9 775 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 DDIT3P35638 169 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 TSPOAP1O95153 1857 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 KRT24Q2M2I5 525 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 AK9Q5TCS8 1911 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 CDC45O75419 566 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 GNAI1P63096 354 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 MCTP1Q6DN14 999 aa14.9□□□□□ -0.02
NLRC3-201ENST00000324659 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 TPM2P07951 284 aa14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 PKP1Q13835 747 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 EID1Q9Y6B2 187 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 PTPRMP28827 1452 aa14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 NEO1Q92859 1461 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 IFT57Q9NWB7 429 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 NECTIN2Q92692 538 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 ABCC4O15439 1325 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 PIK3C2BO00750 1634 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 IL13P35225 146 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-201ENST00000324659 MCM10Q7L590 875 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms