RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXA3-201ENST00000317201 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXA3-201ENST00000317201 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXA3-201ENST00000317201 PIK3C2AO00443 1686 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXA3-201ENST00000317201 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXA3-201ENST00000317201 DCCP43146 1447 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXA3-201ENST00000317201 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.89■□□□□ 0.62
HOXA3-201ENST00000317201 SLFN5Q08AF3 891 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 FCHSD2O94868 740 aa18.88■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 E9PSI1 815 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 IL13P35225 146 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 WDR63Q8IWG1 891 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 WWC1Q8IX03 1113 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 KIF1AQ12756 1690 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 STRCQ7RTU9 1775 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 PDE4AP27815 886 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 C14orf37Q86TY3 774 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
HOXA3-201ENST00000317201 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 FBLN1P23142 703 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 PEAK1Q9H792 1746 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 HSPA2P54652 639 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 SBNO1A3KN83 1393 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM94Q12767 1356 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 MST1RQ04912 1400 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 KLHL34Q8N239 644 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 FLT4P35916 1363 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 NLRP6P59044 892 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 IL16Q14005 1332 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 PSME1Q06323 249 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 ABTB2Q8N961 1025 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
HOXA3-201ENST00000317201 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 RTL1A6NKG5 1358 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 ATF3P18847 181 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 PRKAR2BP31323 418 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF10O15013 1369 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 NEUROD2Q15784 382 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 ORAI2Q96SN7 254 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 BACH2Q9BYV9 841 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 NFAT5O94916 1531 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 SKAP1Q86WV1 359 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 SLIT3O75094 1523 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 MSH6P52701 1360 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 NFE2L2Q16236 605 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 RIPK4P57078 832 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 ARID3AQ99856 593 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 HMOX1P09601 288 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 AMPHP49418 695 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 KDRP35968 1356 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 ALS2Q96Q42 1657 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 USP19O94966 1318 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 FOXO3O43524 673 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 HOXC9P31274 260 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 CLCN1P35523 988 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 LTN1O94822 1766 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA3-201ENST00000317201 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.2 ms