RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287042.4

KCNS2-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS2, Length 5,219 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS2-201ENST00000287042 PDE4CQ08493 712 aa23.14■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 SIL1Q9H173 461 aa23.14■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.14■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.14■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.14■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 XBP1P17861 261 aa23.13■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.13■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.13■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 IDI1Q13907 227 aa23.12■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 BTBD11A6QL63 1104 aa23.12■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 FIBPO43427 364 aa23.12■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.11■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 MYL6BP14649 208 aa23.11■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.11■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 IFT57Q9NWB7 429 aa23.11■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.1■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.1■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.09■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 MCM10Q7L590 875 aa23.09■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 NME9Q86XW9 330 aa23.09■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.09■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.09■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.09■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.09■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.09■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 KINO60870 393 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.08■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
KCNS2-201ENST00000287042 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 ANKRD1Q15327 319 aa23.08■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 AACSQ86V21 672 aa23.08■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.08■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 DCTN1Q14203 1278 aa23.07■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.07■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 OLFM4Q6UX06 510 aa23.07■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.06■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 TSPY26PQ9H489 355 aa23.06■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.06■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.06■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 GPS2Q13227 327 aa23.05■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.05■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.05■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 NOS1P29475 1434 aa23.04■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 TRIM5Q9C035 493 aa23.04■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.04■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.03■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 KDM4AO75164 1064 aa23.03■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 ATP2B1P20020 1258 aa23.03■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.02■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 STK38Q15208 465 aa23.02■■□□□ 1.28
KCNS2-201ENST00000287042 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 PTPRKQ15262 1439 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 STK3Q13188 491 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 MTMR7Q9Y216 660 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 FANCAO15360 1455 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 MCM4P33991 863 aa23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 NSD2O96028 1365 aa23■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 SKAP1Q86WV1 359 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 KRT85P78386 507 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.99■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.98■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.97■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.97■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.97■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 TRIM27P14373 513 aa22.97■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 MX1P20591 662 aa22.97■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
KCNS2-201ENST00000287042 JMYQ8N9B5 988 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms