RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229771.10

TULP1-201, Transcript of tubby like protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TULP1, Length 2,162 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1-201ENST00000229771 SOX12O15370 315 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 CFAP53Q96M91 514 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 USP19O94966 1318 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.36■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 POLKQ9UBT6 870 aa24.36■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.36■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 SSH2Q76I76 1423 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 COG6Q9Y2V7 657 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.33■■□□□ 1.49
TULP1-201ENST00000229771 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 ATF3P18847 181 aa24.33■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 PANK1Q8TE04 598 aa24.33■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 FOXO3O43524 673 aa24.32■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.32■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 PSME1Q06323 249 aa24.31■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.3■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.3■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 NLRP6P59044 892 aa24.29■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 PLEKHG5O94827 1062 aa24.28■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 ABTB2Q8N961 1025 aa24.28■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.27■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.27■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.27■■□□□ 1.48
TULP1-201ENST00000229771 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 MSH6P52701 1360 aa24.24■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.24■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.23■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.23■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 MST1RQ04912 1400 aa24.23■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.23■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.22■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.22■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.22■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.22■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 PIK3C2AO00443 1686 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 NEUROD2Q15784 382 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 SEC24BO95487 1268 aa24.2■■□□□ 1.47
TULP1-201ENST00000229771 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 USP31Q70CQ4 1352 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 RLBP1P12271 317 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 DCCP43146 1447 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 IL13P35225 146 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 HMOX1P09601 288 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 IL16Q14005 1332 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP1-201ENST00000229771 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 AMPHP49418 695 aa24.12■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.12■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.12■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 SLAIN2Q9P270 581 aa24.1■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.1■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.1■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 PEAK1Q9H792 1746 aa24.09■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 BRINP3Q76B58 766 aa24.09■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 PRKAR2BP31323 418 aa24.09■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.09■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TULP1-201ENST00000229771 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.08■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 TNNQ9UQP3 1299 aa24.07■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.06■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 KIF1AQ12756 1690 aa24.06■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 FCHSD2O94868 740 aa24.06■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 SBNO1A3KN83 1393 aa24.05■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.05■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.05■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.05■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TULP1-201ENST00000229771 FLT4P35916 1363 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms