RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 TTC7BQ86TV6 843 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TEX26Q8N6G2 289 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ALG3Q92685 438 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 P3H4Q92791 437 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 HAUS1Q96CS2 278 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 LGMNQ99538 433 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 MYOCQ99972 504 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SEMA3CQ99985 751 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NOD2Q9HC29 1040 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 GGT7Q9UJ14 662 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 A0A1B0GVT2 93 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ARHGAP33O14559 1287 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 AREL1O15033 823 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SLC31A1O15431 190 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CER1O95813 267 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CPP00450 1065 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CA4P22748 312 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 AKT2P31751 481 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PTPN7P35236 360 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 LIMK1P53667 647 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 DSC2Q02487 901 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZBTB17Q13105 803 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 UGP2Q16851 508 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 STPG1Q5TH74 334 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 BBS12Q6ZW61 710 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 KLK6Q92876 244 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SKA1Q96BD8 255 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 FEM1CQ96JP0 617 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 HEMGNQ9BXL5 484 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 EBF2Q9HAK2 575 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 AMACRQ9UHK6 382 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZNF292O60281 2723 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 USP34Q70CQ2 3546 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CEP250Q9BV73 2442 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CACNA1EQ15878 2313 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PI4KAP42356 2102 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 A0A1W2PQ67 120 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 C4orf47A7E2U8 309 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SLC30A4O14863 429 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 VILLO15195 856 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 MTSS1O43312 755 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TJP3O95049 919 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 APOC2P02655 101 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PRKCGP05129 697 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TIMP2P16035 220 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NFKBIAP25963 317 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CD38P28907 300 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 MMP12P39900 470 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PEX5P50542 639 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ADCY2Q08462 1091 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TRAF2Q12933 501 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SGCGQ13326 291 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 STAT4Q14765 748 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NOMO1Q15155 1222 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 KIF19Q2TAC6 998 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ARMC12Q5T9G4 340 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms