RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 LRRC53A6NM62 1247 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SCAMP1O15126 338 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 DESP17661 470 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PFN3P60673 137 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 RAD51Q06609 339 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ISXQ2M1V0 245 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 IFI44Q8TCB0 444 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 LRRC19Q9H756 370 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PARVAQ9NVD7 372 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22.3■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PQC6 194 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 K7ESM1 405 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 FPGTO14772 594 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 CSF2P04141 144 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 TNFAIP3P21580 790 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PRKCIP41743 596 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 TPI1P60174 286 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 RHOAP61586 193 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SGCGQ13326 291 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 CENPTQ96BT3 561 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 DONSONQ9NYP3 566 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.29■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 LRP4O75096 1905 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 A0A1B0GTH6 734 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 TSPAN11A1L157 253 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 H3BM21 787 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 K7ENP7 123 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 NEMP1O14524 444 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SLC28A2O43868 658 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 GZMAP12544 262 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 NDST2P52849 883 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SKOR1P84550 965 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 KCNC4Q03721 635 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.28■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SMTNL1A8MU46 457 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 MYF5P13349 255 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PSMA2P25787 234 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 IGFALSP35858 605 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SUOXP51687 545 aa22.27■■□□□ 1.16
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SRRT-218ENST00000620394 CYTH1Q15438 398 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ASIC2Q16515 512 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SLC46A1Q96NT5 459 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PEBP4Q96S96 227 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 KLF15Q9UIH9 416 aa22.27■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP6O43182 974 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PRAMEF11O60813 436 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NEBLO76041 1014 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TGM2P21980 687 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 GRM3Q14832 879 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 CA9Q16790 459 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 AFMIDQ63HM1 303 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TTC7BQ86TV6 843 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 NETO2Q8NC67 525 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.26■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TOR1BO14657 336 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 INSIG1O15503 277 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TCEA3O75764 348 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TM7SF2O76062 418 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 WISP1O95388 367 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 TIMP2P16035 220 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.25■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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