RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 GGNQ86UU5 652 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF677Q86XU0 584 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CREBRFQ8IUR6 639 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 YAF2Q8IY57 180 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MPP5Q8N3R9 675 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 METTL13Q8N6R0 699 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 AMER2Q8N7J2 671 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RNF152Q8N8N0 203 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR56A1Q8NGH5 318 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIF18AQ8NI77 898 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 POC1BQ8TC44 478 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAET1EQ8TD07 263 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIB2Q92519 343 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPSB4Q96A44 273 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM143Q96AN5 459 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 BOD1Q96IK1 185 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC42Q96M95 316 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NLRP4Q96MN2 994 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SCLT1Q96NL6 688 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIB1Q96RU8 372 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NELL2Q99435 816 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 STK33Q9BYT3 514 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CHST8Q9H2A9 424 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 GANQ9H2C0 597 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CERS4Q9HA82 394 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 DKK2Q9UBU2 259 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 HESX1Q9UBX0 185 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 C2CD2Q9Y426 696 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAD54BQ9Y620 910 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 A0A1B0GUA9 196 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM150BA6NC51 233 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRC53A6NM62 1247 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MARCH11A6NNE9 402 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLCA1A8K7I4 914 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 BTNL10A8MVZ5 291 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KBTBD13C9JR72 458 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 F8VZ95 297 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIF5CO60282 957 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM189A1O60320 539 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNNC2P02585 160 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADRB2P07550 413 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 GZMAP12544 262 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 DARSP14868 501 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSHRP16473 764 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNNI1P19237 187 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PON1P27169 355 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADSSP30520 456 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PNPLA4P41247 253 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PIK3CAP42336 1068 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CASP4P49662 377 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDE6CP51160 858 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLCN3P51790 818 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 VAV2P52735 878 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRKCZQ05513 592 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FPGSQ05932 587 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ABHD18Q0P651 414 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIF5AQ12840 1032 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC29A2Q14542 456 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ASIC2Q16515 512 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC18A3Q16572 532 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms