RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf20Q8ND61 904 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 HMCESQ96FZ2 354 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SELENOOQ9BVL4 669 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PADI4Q9UM07 663 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SIGLEC16A6NMB1 481 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 INSIG1O15503 277 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 STAT1P42224 750 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PEX5P50542 639 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SERINC3Q13530 473 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 IRF4Q15306 451 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM52BQ4KMG9 183 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 EFHC2Q5JST6 749 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC3Q9BQI4 270 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 KIF26BQ2KJY2 2108 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 COL6A6A6NMZ7 2263 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PMS2P1A4D2B8 440 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN8A6NHC0 703 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 WASH4PA8MWX3 477 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CDRT15L2A8MXV6 281 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 RASA4BC9J798 803 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 RASA4O43374 803 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CALB1P05937 261 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 BLKP51451 505 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PDX1P52945 283 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 VAC14Q08AM6 782 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CYTH1Q15438 398 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PARP15Q460N3 678 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 HCAR2Q8TDS4 363 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 LHX3Q9UBR4 397 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CCP110O43303 1012 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 HK3P52790 923 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ELP6Q0PNE2 266 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SPIDRQ14159 915 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC14Q15048 493 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 WSCD2Q2TBF2 565 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 LVRNQ6Q4G3 990 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ARL14Q8N4G2 192 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC2Q96KP1 924 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 COQ6Q9Y2Z9 468 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TENM4Q6N022 2769 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN11A1L157 253 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CREB3O43889 395 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PIGNO95427 931 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TPM2P07951 284 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 XPAP23025 273 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ELOCQ15369 112 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 MON1BQ7L1V2 547 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC14AQ86T13 490 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ARL10Q8N8L6 244 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SUV39H2Q9H5I1 410 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 GULP1Q9UBP9 304 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 FZD10Q9ULW2 581 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 DOLKQ9UPQ8 538 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC187A0A096LP49 1063 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TNFSF15O95150 251 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ALPIP09923 528 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 C6P13671 934 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 AIF1P55008 147 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 GRM3Q14832 879 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 UGP2Q16851 508 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ALG11Q2TAA5 492 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 FOXR1Q6PIV2 292 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 DNAAF5Q86Y56 855 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 HID1Q8IV36 788 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH19Q8TAB3 1148 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TTC9Q92623 222 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH12Q9NPG4 1184 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 INPP5AQ14642 412 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 NFATC4Q14934 902 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 AGERQ15109 404 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SYCP1Q15431 976 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms