RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		12.51	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		12.51	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		12.51	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		12.51	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		12.51	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		12.51	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATM	Q13315	3056 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	FFAR2	O15552	330 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPINT1	O43278	529 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	TPM1	P09493	284 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	RGR	P47804	291 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDH6	P55285	790 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SEMG2	Q02383	582 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL10RB	Q08334	325 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPYS	Q14117	519 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRM3	Q14832	879 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPYSL2	Q16555	572 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	HS1BP3	Q53T59	392 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	AFMID	Q63HM1	303 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	LZTR1	Q8N653	840 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	DKK3	Q9UBP4	350 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM149A	A5PLN7	773 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	AREL1	O15033	823 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	AKR1B10	O60218	316 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRKCG	P05129	697 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SERPINA4	P29622	427 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	RABIF	P47224	123 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCNN1B	P51168	640 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	BCL2L1	Q07817	233 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ELP6	Q0PNE2	266 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRIM14	Q14142	442 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	UGP2	Q16851	508 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ERAP2	Q6P179	960 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	H2AFV	Q71UI9	128 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC25A45	Q8N413	288 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SIGLEC6	O43699	453 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	RFPL3	O75679	317 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	PIAS2	O75928	621 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	DGKA	P23743	735 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CSNK1D	P48730	415 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	RENBP	P51606	427 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	THOP1	P52888	689 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLDN6	P56747	220 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	DAB2	P98082	770 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	FZD2	Q14332	565 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF235	Q14590	738 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC18A3	Q16572	532 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	VSTM4	Q8IW00	320 aa		12.48	□□□□□ -0.41
NEDD4L-233	ENST00000591989	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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