RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TYMP	P19971	482 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	GRIK1	P39086	918 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A3	P40879	764 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	NDST2	P52849	883 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PKNOX1	P55347	436 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SQLE	Q14534	574 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ACAP2	Q15057	778 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SLC14A2	Q15849	920 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CNST	Q6PJW8	725 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	KDELC1	Q6UW63	502 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	GCNA	Q96QF7	691 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TRMO	Q9BU70	441 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRD	P23468	1912 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM38	O00635	465 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA4	P43681	627 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD8	P48556	350 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SULT2A1	Q06520	285 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PTK2B	Q14289	1009 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ARTN	Q5T4W7	220 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TOP1MT	Q969P6	601 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SGF29	Q96ES7	293 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SUSD3	Q96L08	255 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0U1RQF3	1178 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM233	B4DJY2	109 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MGAT3	Q09327	533 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PCSK7	Q16549	785 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SCD5	Q86SK9	330 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MARK4	Q96L34	752 aa		18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SLC7A4	O43246	635 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	IGHA2	P01877	340 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	GSTT1	P30711	240 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A2	Q01362	244 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	NCSTN	Q92542	709 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ASB9	Q96DX5	294 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM209	Q96SK2	561 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MPP6	Q9NZW5	540 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PADI3	Q9ULW8	664 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559		A8MT66	165 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ACOT8	O14734	319 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	UBD	O15205	165 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CAPNS1	P04632	268 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC166	P0CW27	439 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MARC1	Q5VT66	337 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	NPAS2	Q99743	824 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	OLFM1	Q99784	485 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SYT17	Q9BSW7	474 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	VWA7	Q9Y334	891 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MYLK	Q15746	1914 aa		18.53	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MYADML2	A6NDP7	307 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJA2	O60884	412 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	RHOQ	P17081	205 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	DPP6	P42658	865 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	INHBC	P55103	352 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PSME3	P61289	254 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TLR1	Q15399	786 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf80	Q86SX3	495 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CUZD1	Q86UP6	607 aa		18.52	■□□□□ 0.56

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