RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 NCAPHQ15003 741 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 IGFBP7Q16270 282 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 MYLK3Q32MK0 819 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 GDPD4Q6W3E5 623 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 IL22RA1Q8N6P7 574 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 GPR156Q8NFN8 814 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 HAPLN3Q96S86 360 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 B3GNT4Q9C0J1 378 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 TUBD1Q9UJT1 453 aa18.02■□□□□ 0.48
TSPAN3-204ENST00000558394 LRRK2Q5S007 2527 aa18.02■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 BICDL2A1A5D9 508 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 I6L893 689 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 PNLIPP16233 465 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 CASRP41180 1078 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 FOXK1P85037 733 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SPRED1Q7Z699 444 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TAF8Q7Z7C8 310 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM26EQ8N5C1 309 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM46DQ8NEK8 389 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TBCBQ99426 244 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC12A9Q9BXP2 914 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 LRIT1Q9P2V4 623 aa18.01■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 NBASA2RRP1 2371 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ZW10O43264 779 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ACVRL1P37023 503 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ELP6Q0PNE2 266 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 PTPN20Q4JDL3 420 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 CERCAMQ5T4B2 595 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ISM2Q6H9L7 571 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 PIM3Q86V86 326 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF354CQ86Y25 554 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TRIM59Q8IWR1 403 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 GPBAR1Q8TDU6 330 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 WDR92Q96MX6 357 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 CATSPER2Q96P56 530 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 APOOQ9BUR5 198 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 PDCL3Q9H2J4 239 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 LRP4O75096 1905 aa18■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SDK2Q58EX2 2172 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 BECN2A8MW95 431 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 B4DGG1 531 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 CD160O95971 181 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 INPP5AQ14642 412 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 C14orf28Q4W4Y0 310 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 GJB7Q6PEY0 223 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SLITRK4Q8IW52 837 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 NELFBQ8WX92 580 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 NT5C3BQ969T7 300 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SEMA6CQ9H3T2 930 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 DPEP2Q9H4A9 486 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF212Q9UDV6 495 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 COQ6Q9Y2Z9 468 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 OR1A2Q9Y585 309 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.99■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 CPNE6O95741 557 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 IGSF6O95976 241 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SUOXP51687 545 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 C16orf72Q14CZ0 275 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 WSCD2Q2TBF2 565 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TTI2Q6NXR4 508 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TRIM65Q6PJ69 517 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC112Q8NEF3 446 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SPATA20Q8TB22 786 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 NKD1Q969G9 470 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TAAR9Q96RI9 348 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 NCAPGQ9BPX3 1015 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 DNAI1Q9UI46 699 aa17.98■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 RELNP78509 3460 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TEX15Q9BXT5 2789 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 PCCBP05166 539 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TIMP2P16035 220 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 ITIH2P19823 946 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 MAPKAPK2P49137 400 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 BIRC2Q13490 618 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 AMZ1Q400G9 498 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 TMEM52BQ4KMG9 183 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 OGFOD3Q6PK18 319 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM131BQ86XD5 332 aa17.97■□□□□ 0.47
TSPAN3-204ENST00000558394 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms