RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	ESX1	Q8N693	406 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	RTP4	Q96DX8	246 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	ELP4	Q96EB1	424 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	BBS4	Q96RK4	519 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLRF2	D3W0D1	207 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC28A2	O43868	658 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	RGS11	O94810	467 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CH25H	O95992	272 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	UROD	P06132	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	DAO	P14920	347 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRD5A1	P18405	259 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHAT	P28329	748 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCKBR	P32239	447 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	DSCR9	P59020	149 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	UFM1	P61960	85 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ECT2L	Q008S8	904 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	NFATC4	Q14934	902 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC39A14	Q15043	492 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SHF	Q7M4L6	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSPYL6	Q8N831	410 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	HTRA1	Q92743	480 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF125	Q96EQ8	232 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR1F2P	Q96R84	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CD93	Q9NPY3	652 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCND2	Q9NZV8	630 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDP2	Q9P2J9	529 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRRC53	A6NM62	1247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MXI1	P50539	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ART1	P52961	327 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GALNT2	Q10471	571 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TCTN1	Q2MV58	587 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF585B	Q52M93	769 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALF	Q53S48	1182 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBXL8	Q96CD0	374 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	DUX5	Q96PT3	197 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	NUF2	Q9BZD4	464 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GJD2	Q9UKL4	321 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CKAP5	Q14008	2032 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	UTY	O14607	1347 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	LINC01553	A4QN01	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TACC1	O75410	805 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAGE7	O76087	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAGE12F	P0CL80	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAGE12G	P0CL81	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAGE12I	P0CL82	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAGE1	Q13065	139 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAGE4	Q13068	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KEAP1	Q14145	624 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GSTA3	Q16772	222 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ESCO2	Q56NI9	601 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	NFKBID	Q8NI38	313 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPT2	Q8TD30	523 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ST8SIA4	Q92187	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHL29	Q96CT2	875 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	NFS1	Q9Y697	457 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	EVPL	Q92817	2033 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A0U1RQJ8	604 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	DYTN	A2CJ06	578 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CBY3	A6NI87	242 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CREB3	O43889	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TIPRL	O75663	272 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	HEXA	P06865	529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	STX2	P32856	288 aa		5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms