RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 WDCPQ9H6R7 721 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 DTLQ9NZJ0 730 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 C5orf60A6NFR6 353 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 PLK4O00444 970 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNN4O15554 427 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SHBGP04278 402 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TSHRP16473 764 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 RBL1P28749 1068 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ARL4CP56559 192 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 GBE1Q04446 702 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 RFX8Q6ZV50 586 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TAC4Q86UU9 113 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB9Q96C00 473 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SERPINB12Q96P63 405 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM24O15164 1050 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 IRAK2O43187 625 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNJ11Q14654 390 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 STAT4Q14765 748 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 PDK1Q15118 436 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 HIF1AQ16665 826 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 KYNUQ16719 465 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ANO4Q32M45 955 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SCD5Q86SK9 330 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 EDEM1Q92611 657 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 HAPLN3Q96S86 360 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC77Q9BR77 488 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR174Q9BXC1 333 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 PPCSQ9HAB8 311 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 KNL1Q8NG31 2342 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 GFRA2O00451 464 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 RASGRF2O14827 1237 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 AGTP01019 485 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 IVLP07476 585 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 NR1D1P20393 614 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TAF10Q12962 218 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 DHRS13Q6UX07 377 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM25Q86YD3 366 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 EPAS1Q99814 870 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 CLMPQ9H6B4 373 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 COX16Q9P0S2 106 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-204ENST00000548823 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 METTL12A8MUP2 240 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 GRK6P43250 576 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PSEN1P49768 467 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TPI1P60174 286 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC157Q569K6 752 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 KCTD16Q68DU8 428 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PCSK4Q6UW60 755 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MCUQ8NE86 351 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PWWP2AQ96N64 755 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 KLC2Q9H0B6 622 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 I6L893 689 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CREB3O43889 395 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ACSL3O95573 720 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PDIK1LQ8N165 341 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SERPINB11Q96P15 392 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms