RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 DCLK2Q8N568 766 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 GPR150Q8NGU9 434 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 STYXQ8WUJ0 223 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 PTPRN2Q92932 1015 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 ATP2A3Q93084 1043 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 VPS39Q96JC1 886 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 GPR22Q99680 433 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 PIDD1Q9HB75 910 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 MARK1Q9P0L2 795 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 MSRAQ9UJ68 235 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-209ENST00000547449 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 KLF11O14901 512 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 SNX3O60493 162 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CRTAMO95727 393 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 MT-CO1P00395 513 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 IL1BP01584 269 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PBX2P40425 430 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 SULT2A1Q06520 285 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 ITIH4Q14624 930 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 LCA5Q86VQ0 697 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 RIN3Q8TB24 985 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PBX4Q9BYU1 374 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 FAM107BQ9H098 131 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 SNX15Q9NRS6 342 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PLK2Q9NYY3 685 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.846e-7■■■□□ 16.2
CS-209ENST00000547449 HACD3Q9P035 362 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CHKBQ9Y259 395 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CCDC78A2IDD5 438 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PRAMEF12O95522 483 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 S1PR4O95977 384 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 C2P06681 752 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 COL6A2P12110 1019 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CEBPBP17676 345 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CRABP2P29373 138 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 HLA-FP30511 346 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CD151P48509 253 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 NRIP1P48552 1158 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 NUMBP49757 651 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 TRAF2Q12933 501 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CTBP1Q13363 440 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 GALNT3Q14435 633 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 GRM3Q14832 879 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PPM1JQ5JR12 505 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 CLEC14AQ86T13 490 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 PLPP6Q8IY26 295 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 TTC16Q8NEE8 873 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-209ENST00000547449 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms