RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 SDR42E2A6NKP2 422 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 NDST3O95803 873 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 CPP00450 1065 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 ELK3P41970 407 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 PMS2P54278 862 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 GRM3Q14832 879 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 POU6F1Q14863 301 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 POM121L1PQ3SYA9 428 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 C9orf64Q5T6V5 341 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 DENND5AQ6IQ26 1287 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 GDPD4Q6W3E5 623 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 FBXO36Q8NEA4 188 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 OR8D1Q8WZ84 308 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 SUV39H2Q9H5I1 410 aa26.71■■□□□ 1.87
NDUFS3-211ENST00000533507 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF40O75150 1001 aa26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 EPOP01588 193 aa26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 HLA-DPA1P20036 260 aa26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CAVIN3Q969G5 261 aa26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 KLHL32Q96NJ5 620 aa26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SYBUQ9NX95 663 aa26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SAMD15Q9P1V8 674 aa26.7■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 NPC1O15118 1278 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 PIRTP0C851 137 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 NTSR1P30989 418 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC8A1P32418 973 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 NPY2RP49146 381 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 PALM2Q8IXS6 379 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 GJD3Q8N144 294 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIB3Q96RU7 358 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 WASF2Q9Y6W5 498 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SHISA7A6NL88 538 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SOCS5O75159 536 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 PGLSO95336 258 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 PRLP01236 227 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 FGF1P05230 155 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CTSLP07711 333 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 MAGEA3P43357 314 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 PRKCQQ04759 706 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 KYNUQ16719 465 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC38Q502W7 563 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SEMA4AQ9H3S1 761 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 PRSS16Q9NQE7 514 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 WNT16Q9UBV4 365 aa26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 E7ESA3 106 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 STK25O00506 426 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ALOX15BO15296 676 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 IL1BP01584 269 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SEPT6Q14141 434 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 FBXO43Q4G163 708 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SIX5Q8N196 739 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 IL17RCQ8NAC3 791 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CFAP36Q96G28 342 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SIGLEC10Q96LC7 697 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 IL22Q9GZX6 179 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ARNT2Q9HBZ2 717 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 MUTYHQ9UIF7 546 aa26.68■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC78A2IDD5 438 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD66B4E2M5 251 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 PRKCGP05129 697 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CTPS1P17812 591 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 UBXN2BQ14CS0 331 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 IGDCC3Q8IVU1 814 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 KCNV2Q8TDN2 545 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SHDQ96IW2 340 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 TEX264Q9Y6I9 313 aa26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 KRBA1A5PL33 1030 aa26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ACSL3O95573 720 aa26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 PRNPP04156 253 aa26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CCINQ13939 588 aa26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CACUL1Q86Y37 369 aa26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 SMIM14Q96QK8 99 aa26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 FZD6O60353 706 aa26.66■■□□□ 1.86
NDUFS3-211ENST00000533507 HOXB2P14652 356 aa26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms