RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533105.1

NDUFS3-210, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 4

Gene NDUFS3, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-210ENST00000533105 TSPAN11A1L157 253 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 DKK1O94907 266 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 DGKAP23743 735 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SERPINB6P35237 376 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 RENBPP51606 427 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SUOXP51687 545 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SEMG2Q02383 582 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 BCL2L1Q07817 233 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
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NDUFS3-210ENST00000533105 ZNF235Q14590 738 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SLC25A45Q8N413 288 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 KCTD6Q8NC69 237 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 ZNF599Q96NL3 588 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 UCKL1Q9NWZ5 548 aa22.13■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SPEGQ15772 3267 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 FFAR2O15552 330 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 TMEM253P0C7T8 217 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 IL4RP24394 825 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 FZD2Q14332 565 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 DHRS13Q6UX07 377 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 CENPTQ96BT3 561 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 PSKH2Q96QS6 385 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 TRIM5Q9C035 493 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.12■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MAFKO60675 156 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 PIAS2O75928 621 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 TAS2R40P59535 323 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 AP1S1P61966 158 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 DPYSL3Q14195 570 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MESDQ14696 234 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 HS1BP3Q53T59 392 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 PARGQ86W56 976 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 CNGA4Q8IV77 575 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 BBS5Q8N3I7 341 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 IFT43Q96FT9 208 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 GPR27Q9NS67 375 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.11■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.11■■□□□ 1.13
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NDUFS3-210ENST00000533105 SIGLEC6O43699 453 aa22.1■■□□□ 1.13
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NDUFS3-210ENST00000533105 ARSEP51690 589 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 THOP1P52888 689 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 PFN3P60673 137 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MARCH9Q86YJ5 346 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 FAM71BQ8TC56 605 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 FRYQ5TBA9 3013 aa22.1■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 RFPL3O75679 317 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 CSF2P04141 144 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 C6P13671 934 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 CKMT2P17540 419 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MMP12P39900 470 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 ACADVLP49748 655 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 LIG3P49916 1009 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 PDK2Q15119 407 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 IRF4Q15306 451 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MARC1Q5VT66 337 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.09■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 AKAP13Q12802 2813 aa22.08■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 FAM149AA5PLN7 773 aa22.08■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 H3BM21 787 aa22.08■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MFSD11O43934 449 aa22.08■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NDUFS3-210ENST00000533105 MMP13P45452 471 aa22.08■■□□□ 1.13
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